D21S11


Other Names

Chromosomal Location

GenBank Accession

 

  21q21.1

M84567; has 26 repeat units


AP000433
; has 29.1 repeat units

Repeat: [TCTA], [TCTG]= GenBank top strand
 

Reported Primers

Ref.

PCR Primer Sequences

Set 1

613, 34

5'-GTG AGT CAA TTC CCC AAG-3'

5'-GTT GTA TTA GTC AAT GTT CTC C-3'

Set 2

5

5'-ATA TGT GAG TCA ATT CCC CAA G-3'

5'-TGT ATT AGT CAA TGT TCT CCA G-3'

Set 3

ABI

AmpFlSTR® Profiler Plus™

Set 4

Promega

GenePrint® PowerPlex™ 2.1

PCR Product Sizes of Observed Alleles
 

Allele    (Repeat #)

(Ref. # 34)

Allele    (Repeat #)

(Ref. # 5)

Set 1,2

Set 3

Set 4

Repeat Structure

Ref.

24

53

202 bp

186 bp

203 bp

[TCTA]4 [TCTG]6 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCATA [TCTA]6

716

24.2

54

204 bp 

188 bp

205 bp

[TCTA]4 [TCTG]6 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]8

312

25

55

206 bp

190 bp

207 bp

[TCTA]4 [TCTG]3 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]10

312

25.2

56

208 bp

192 bp

209 bp

[TCTA]5 [TCTG]6 [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]10

716

26

57

210 bp

194 bp

211 bp

[TCTA]4 [TCTG]6 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]8

34

26.1

 

211 bp

195 bp

212 bp

 

SGM Plus

26.2

58

212 bp

196 bp

213 bp

 

variant allele

27

59

214 bp

198 bp

215 bp

[TCTA]4 [TCTG]6 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]9

34

27'

59

214 bp

198 bp

215 bp

[TCTA]6 [TCTG]5 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]8

34

27"

59

214 bp

198 bp

215 bp

[TCTA]5 [TCTG]5 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]9

716

27.2

 

216 bp

200 bp

217 bp

 

SGM Plus

27.3

 

217 bp

201 bp

218 bp

 

SGM Plus

28

61

218 bp

202 bp

219 bp

[TCTA]4 [TCTG]6 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]10

34

28'

 

218 bp

202 bp

219 bp

[TCTA]5 [TCTG]6 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]9

490

28.2

62

220 bp

204 bp

221 bp

[TCTA]4 [TCTG]6 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]10

716

28.2'

 

220 bp

204 bp

221 bp

[TCTA]5 [TCTG]6 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]8 TA TCTA

490

28.3

 

221 bp

205 bp

222 bp

 

SGM Plus

29

63

222 bp

206 bp

223 bp

[TCTA]4 [TCTG]6 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]11

34

29'

63

222 bp

206 bp

223 bp

[TCTA]6 [TCTG]5 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]10

490

29.1

 

223 bp

207 bp

224 bp

 

SGM Plus

29.1

 

223 bp

207 bp

224 bp

[TCTA]4 [TCTG]6 [TCTA]6 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]11

GenBank AP000433

29.2

64

224 bp

208 bp

225 bp

[TCTA]5 [TCTG]5 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]10 TA TCTA

490

29.3

 

225 bp

209 bp

226 bp

 

SGM Plus

30

65

226 bp

210 bp

227 bp

[TCTA]6 [TCTG]5 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]11

34

30'

65

226 bp

210 bp

227 bp

[TCTA]5 [TCTG]6 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]11

490

30"

65

226 bp

210 bp

227 bp

[TCTA]4 [TCTG]6 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]12

312

30"'

65

226 bp

210 bp

227 bp

[TCTA]6 [TCTG]6 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]10

404

30.1

 

227 bp

211 bp

228 bp

 

SGM Plus

30.2

66

228 bp

212 bp

229 bp

[TCTA]5 [TCTG]6 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]10 TA TCTA

34

31

67

230 bp

214 bp

231 bp

[TCTA]5 [TCTG]6 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]12

716

31'

67

230 bp

214 bp

231 bp

[TCTA]6 [TCTG]5 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]12

34

31"

67

230 bp

214 bp

231 bp

[TCTA]6 [TCTG]6 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]11

490

31"'

67

230 bp

214 bp

231 bp

[TCTA]7 [TCTG]5 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]11

312

31.1

 

231 bp

215 bp

232 bp

 

SGM Plus

31.2

68

232 bp

216 bp

233 bp

[TCTA]5 [TCTG]6 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]11 TA TCTA

34

31.3

 

233 bp

217 bp

234 bp

 

SGM Plus

32

69

234 bp

218 bp

235 bp

[TCTA]6 [TCTG]5 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]13

34

32'

69

234 bp

218 bp

235 bp

[TCTA]5 [TCTG]6 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]13

490

32.1

 

235 bp

219 bp

236 bp

 

SGM Plus

32.2

70

236 bp

220 bp

237 bp

[TCTA]5 [TCTG]6 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]12 TA TCTA

34

32.2'

70

236 bp

220 bp

237 bp

[TCTA]4 [TCTG]6 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]13 TA TCTA

404

32.2"

70

236 bp

220 bp

237 bp

[TCTA]5 [TCTG]6 [TCTA]2 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]13 TA TCTA

404

32.3

 

237 bp

221 bp

238 bp

 

SGM Plus

33

71

238 bp

222 bp

239 bp

[TCTA]5 [TCTG]6 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]14

490

33.2

72

240 bp

224 bp

241 bp

[TCTA]5 [TCTG]6 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]13 TA TCTA

34

33.2'

72

240 bp

224 bp

241 bp

[TCTA]6 [TCTG]5 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]13 TA TCTA

404

33.2"

72

240 bp

224 bp

241 bp

[TCTA]6 [TCTG]6 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]12 TA TCTA

404

33.3

 

241 bp

225 bp

242 bp

[TCTA]5 [TCTG]6 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]8 TCA [TCTA]2 TA TCTA

404

34

73

242 bp

226 bp

243 bp

[TCTA]10 [TCTG]5 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]11 

404

34'

73

242 bp

226 bp

243 bp

[TCTA]5 [TCTG]6 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]15 

490

34.2

74

244 bp

228 bp

245 bp

[TCTA]4 [TCTG]6 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]14 TA TCTA

34

34.3

 

245 bp

229 bp

246 bp

[TCTA]5 [TCTG]6 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]10 TCA [TCTA]4TA TCTA

404

35

75

246 bp

230 bp

247 bp

[TCTA]11 [TCTG]5 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]11

404

35'

75

246 bp

230 bp

247 bp

[TCTA]10 [TCTG]5 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]12

716

35.1

 

247 bp

231 bp

248 bp

 

variant allele

35.2

76

248 bp

232 bp

249 bp

[TCTA]5 [TCTG]6 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]15 TA TCTA

490

35.3

 

249 bp

233 bp

250 bp

 

SGM Plus

36

77

250 bp

234 bp

251 bp

[TCTA]10 [TCTG]5 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]13 

404

36'

77

250 bp

234 bp

251 bp

[TCTA]11 [TCTG]5 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]12

716

36"

77

250 bp

234 bp

251 bp

[TCTA]10 [TCTG]6 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]12

404

36.2

 

252 bp

236 bp

253 bp

[TCTA]5 [TCTG]6 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]16 TA TCTA

490

36.3

 

253 bp

237 bp

254 bp

 

SGM Plus

37

78

254 bp

238 bp

255 bp

[TCTA]9 [TCTG]11 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]12

404

37'

78

254 bp

238 bp

255 bp

[TCTA]11 [TCTG]5 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]13

716

37.2

 

256 bp

240 bp

257 bp

 

SGM Plus

38

79

258 bp

242 bp

259 bp

[TCTA]9 [TCTG]11 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]13 

404

38'

79

258 bp

242 bp

259 bp

[TCTA]13 [TCTG]5 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]12

716

38"

79

258 bp

242 bp

259 bp

[TCTA]10 [TCTG]11 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]13 

404

38"'

79

258 bp

242 bp

259 bp

[TCTA]11 [TCTG]11 [TCTA]3 TA [TCTA]3 TCA [TCTA]2 TCCA TA [TCTA]11 

404

38.2

 

260 bp

244 bp

261 bp

 

SGM Plus

Explanation of the various allele nomenclatures

Allelic Ladders: Commercially available from Applied Biosystems, Promega

Common Multiplexes: Green STR II, AmpFlSTR® Profiler Plus™, GenePrint® PowerPlex™ 2.1

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